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明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

在人類快速的發(fā)展下，人類和妖怪之間的平衡被打破。隨著環(huán)境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉(xiāng)生活在人類城市。然而妖怪卻沒(méi)有屬于自己的法律保障和社會(huì)權(quán)力，這是一個(gè)人類為妖怪構(gòu)建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運(yùn)呢？

生于震那帝國(guó)的宋江，是一名正義感和好奇心強(qiáng)烈的采風(fēng)，在一次際遇中被卷入禁軍的紛爭(zhēng)中，得到“天印”的能力，化險(xiǎn)為夷。帝國(guó)能源“星石”日漸枯竭，化解這一問(wèn)題的線索，就藏在震那初代帝王所造的九顆天印中。 帝國(guó)太尉高俅聲稱履行帝王的旨意，開始了對(duì)天印的強(qiáng)行回收計(jì)劃。面對(duì)帝國(guó)禁軍的異動(dòng)，反抗帝國(guó)的勢(shì)力紛紛崛起。江決心要平息這場(chǎng)紛亂，一路上聯(lián)絡(luò)志同道合的英豪，率領(lǐng)著以劉武山為據(jù)點(diǎn)的反抗軍，開始了討伐高俅。