明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

一個(gè)滿是“門”的空間，這里被稱之為閥限世界，在這里門就是水閥，怪物是水流，一旦閥門失控怪物便會(huì)破門而出，如潮水般的涌入現(xiàn)實(shí)世界， 而兩個(gè)時(shí)間線里的兩支隊(duì)伍，分別是無(wú)以名為首的神仙組，段武常為首的超物質(zhì)調(diào)查團(tuán)隊(duì)，他們?yōu)樽柚惯@場(chǎng)末日浩劫，決定奮力一戰(zhàn)！ 隨著調(diào)查的深入，一個(gè)更大的陰謀浮出水面！

由于人族的貪婪，其他種族逐漸在一次次的混戰(zhàn)中隱匿了痕跡——混戰(zhàn)中水中界被納入地上界版圖，除了精靈族，現(xiàn)在地上界的情況是這樣的：異族在人族中只剩下了傳說(shuō)和教會(huì)的宣傳口號(hào)，但是除了精靈族外的其他種族其實(shí)在地上界還各有活動(dòng)，只是隱藏了真實(shí)身份。拉法爾，來(lái)自天上界的精靈，由于不可告人的秘密來(lái)到人間界，遇見各色各樣的人類，并與其中三個(gè)伙伴組成團(tuán)隊(duì)一起粉碎邪惡的陰謀。