明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥靈對(duì)話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁的同時(shí)也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

十萬年前，忘仙宗老祖陳玄無敵于天下卻在巔峰時(shí)退隱，無人知曉，他是因系統(tǒng)金手指故障無法繼續(xù)突破，擔(dān)心晚節(jié)不保，才隱居世間的。某天，宗門后代女弟子前來求救，卻讓系統(tǒng)成功重啟……只要培養(yǎng)后代，他可以繼續(xù)變強(qiáng)，可以繼續(xù)獨(dú)斷萬古！躲了十萬年的玄天帝，帶著全新的金手指出山了……

在人類快速的發(fā)展下，人類和妖怪之間的平衡被打破。隨著環(huán)境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉(xiāng)生活在人類城市。然而妖怪卻沒有屬于自己的法律保障和社會(huì)權(quán)力，這是一個(gè)人類為妖怪構(gòu)建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運(yùn)呢？