故事講述了個性開朗喜歡搗亂的小學生布丁，和性格有點暴躁的黃連，倆人的日常校園生活故事。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

九千年前，仙武帝尊率領百萬神將打入太古洪荒，卻無一人歸來，只有一縷真火遺留世間。 九千年后，門派廢徒葉辰，被趕出宗門，無以為家，機緣巧合之下偶得真火，再踏仙武之路。 這是一個神魔仙佛并立的世界，這是一個諸天萬域混亂的年代，葉辰的逆天征途，由此開始。